农历五月正是天气炎热、疾病多发的季节，很多毒蛇害虫都在五月繁殖活跃起来，经常给人造成危害。五月有五毒，为了防御疾病，增强健康，到了五月端午之时，人们便要遍踏百草，采集药材。民间习俗认为，端午是草木一年中药性最强的一天,端午遍地皆药，这天最适合炮制。在民间，一直有“端午节期间，百草为药”的说法，《清嘉录》介绍了苏州这天“采百草”的习俗：
士人采百草之可疗疾者，留以供药饵，俗称“草头方”。药市收癞虾蟇，刺取其沫，谓之“蟾酥”，为修合丹丸之用，率以万计。人家小儿女之未痘者，以水畜养癞虾蟇五个或七个，俟其吐沫。过午，取水煎汤浴之，令痘疮稀。苏州是吴门医派的发源地,传统制药业发达。明末，苏州吴县人吴有性在祟祯15年(公元1642年)写了著名的《温疫论》，被誉为我国第一部治疗传染病的专著。他在书中认为，瘟疫的传播途径主要有两条，一为“天受”，一为“传染” ，瘟疫的病因由于“四时不正之气”，感染“戾气”而成。正因为如此，今天看待古人在端午节挂艾叶、洒雄黄、佩香囊，都是为了预防“戾气”。
如此，端午堪称中国传统的医药节了。
